2021-12-20-回顾+2021-12-21计划 这是一篇付费文章 2021-12-20 财富专栏 财富 Go analysis 2021-10-12 chaoyuny Workfollow for RNAseq 这是一篇付费文章 2021-09-30 RNAseq专栏 转录组数据 R语言 生物信息学 Count转化为TPM或FPKM rm(list = ls()) library(openxlsx) library(tidyverse) count_raw <- read.xlsx("../all.counts.length.deg. 2021-08-21 chaoyuny R语言之-转录组数据3维PCA图及相关性热图 #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~# #~~~~~~~~~~~~~~~~ 2021-08-17 chaoyuny 富集分析可视化-高级教程 GO富集分析可视化先上代码 rm(list = ls()) library(openxlsx) library(tidyverse) library(ggplot2) data=read.xlsx("sal 2021-08-14 R语言可视化专栏 转录组数据 R语言 生物信息学 富集图 GO分析 KEGG分析 WGCNA分析专栏总结-会敲键盘就能完成的WGCNA分析攻略 这是一篇付费文章。 2021-08-07 WGCNA专栏 WGCNA 转录组数据 R语言 生物信息学 WGCNA分析专栏3-表型关联及可视化与重要基因识别 经过前面两个专栏的讲解,我们从数据的预处理,到数据模块构建,洋洋洒洒拆解了大概1万字左右的教程,在这个过程中,我自己也学到了不少的东西,感谢好友们的盛情让我学习到很多东西!今天争取把这个教程后面剩下的内容结了。 1. 模块与表型值的关联老 2021-07-18 WGCNA专栏 WGCNA 转录组数据 R语言 生物信息学 全速上传测序数据至NCBI数据库 今天由于投稿需要,要求将测序的原始数据上传至NCBI或者ENA数据库,于是网上查了半天教程,似乎讲得都不怎么完全,对于第一次接触的人来说还是挺不友好,于是综合各家手法,得到了今天这一套教程。 1. 注册NCBI的账号没有账号的点击这儿注册 2021-07-17 linux专栏 转录组数据 R语言 生物信息学 NCBI 上传数据 WGCNA分析专栏2-网络构建与模块识别 2. 网络构建与模块识别2.0 对上一期博客的补充与说明上一期博客中,我们使用的数据大约1600条,但是当我们筛选 soft threshold 的时候出现了歪瓜裂枣!如下: 全部基因: 约600个基因: 还是一个样子,所以这样的数 2021-07-15 WGCNA专栏 WGCNA 转录组数据 R语言 生物信息学