归档 | 朝云老哥

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2021-12-20-回顾+2021-12-21计划

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2021-12-20 财富专栏

财富

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Go analysis

2021-10-12 chaoyuny

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Workfollow for RNAseq

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2021-09-30 RNAseq专栏

转录组数据 R语言生物信息学

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Count转化为TPM或FPKM

rm(list = ls()) library(openxlsx) library(tidyverse) count_raw <- read.xlsx("../all.counts.length.deg.

2021-08-21 chaoyuny

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R语言之-转录组数据3维PCA图及相关性热图

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2021-08-17 chaoyuny

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富集分析可视化-高级教程

GO富集分析可视化先上代码 rm(list = ls()) library(openxlsx) library(tidyverse) library(ggplot2) data=read.xlsx("sal

2021-08-14 R语言可视化专栏

转录组数据 R语言生物信息学富集图 GO分析 KEGG分析

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WGCNA分析专栏总结-会敲键盘就能完成的WGCNA分析攻略

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2021-08-07 WGCNA专栏

WGCNA 转录组数据 R语言生物信息学

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WGCNA分析专栏3-表型关联及可视化与重要基因识别

经过前面两个专栏的讲解，我们从数据的预处理，到数据模块构建，洋洋洒洒拆解了大概1万字左右的教程，在这个过程中，我自己也学到了不少的东西，感谢好友们的盛情让我学习到很多东西！今天争取把这个教程后面剩下的内容结了。 1. 模块与表型值的关联老

2021-07-18 WGCNA专栏

WGCNA 转录组数据 R语言生物信息学

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全速上传测序数据至NCBI数据库

今天由于投稿需要，要求将测序的原始数据上传至NCBI或者ENA数据库，于是网上查了半天教程，似乎讲得都不怎么完全，对于第一次接触的人来说还是挺不友好，于是综合各家手法，得到了今天这一套教程。 1. 注册NCBI的账号没有账号的点击这儿注册

2021-07-17 linux专栏

转录组数据 R语言生物信息学 NCBI 上传数据

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WGCNA分析专栏2-网络构建与模块识别

2. 网络构建与模块识别2.0 对上一期博客的补充与说明上一期博客中，我们使用的数据大约1600条，但是当我们筛选 soft threshold 的时候出现了歪瓜裂枣！如下: 全部基因：约600个基因：还是一个样子，所以这样的数

2021-07-15 WGCNA专栏

WGCNA 转录组数据 R语言生物信息学