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WGCNA分析专栏总结-会敲键盘就能完成的WGCNA分析攻略 WGCNA分析专栏总结-会敲键盘就能完成的WGCNA分析攻略
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2021-08-07
WGCNA分析专栏3-表型关联及可视化与重要基因识别 WGCNA分析专栏3-表型关联及可视化与重要基因识别
经过前面两个专栏的讲解,我们从数据的预处理,到数据模块构建,洋洋洒洒拆解了大概1万字左右的教程,在这个过程中,我自己也学到了不少的东西,感谢好友们的盛情让我学习到很多东西!今天争取把这个教程后面剩下的内容结了。 1. 模块与表型值的关联老
2021-07-18
WGCNA分析专栏2-网络构建与模块识别 WGCNA分析专栏2-网络构建与模块识别
2. 网络构建与模块识别2.0 对上一期博客的补充与说明上一期博客中,我们使用的数据大约1600条,但是当我们筛选 soft threshold 的时候出现了歪瓜裂枣!如下: 全部基因: 约600个基因: 还是一个样子,所以这样的数
2021-07-15
WGCNA分析专栏1-数据准备 WGCNA分析专栏1-数据准备
1. 简要概述1.1 WGCNA用来做什么Weighted Gene Co-Expression Network Analysis(WGCNA, 加权基因共表达网络分析),主要用于鉴定表达模式相似的基因集合(module)。解析基因集合与样
2021-07-13